La ribonucleotide reduttasi (RR o RNR, conosciuta anche come ribonucleoside difosfato reduttasi) è un enzima che catalizza la formazione di deossiribonucleotidi a partire da ribonucleotidi. La reazione serve a fornire basi azotate per la sintesi del DNA, ed è conservata in tutti gli organismi viventi. I substrati dell'enzima sono: ADP, GDP, UDP e CDP, anche se alcune ribonucleotide reduttasi accettano anche CTP. Il meccanismo della reazione è il seguente:

ribonucleoside difosfato tioredossina ⇄ 2′-deossiribonucleoside difosfato tioredossina disolfuro H2O

L'enzima è una proteina ferro-dipendente.

Funzionamento e regolazione

L'enzima contiene tre siti principali di interesse:

  • Sito catalitico, in cui il nucleotide si lega affinché il suo zucchero diventi deossiribosio.
  • Sito allosterico di specificità, in cui viene determinato quale nucleotide debba essere ridotto dall'enzima. Il legame con l'adenosina trifosfato o con il dATP porta il sito catalitico a legare UDP e CDP/CTP, il legame con il dTTP fa legare l'enzima al GDP mentre il legame con il dGTP porta il complesso ad interessarsi all'ADP come substrato.
  • Sito allosterico di attività, in cui l'enzima si lega all'ATP o al dATP: a seconda della molecola considerata, la ribonucleotide reduttasi sarà rispettivamente attivata o disattivata. Ciò avviene perché un legame con l'ATP testimonia alta disponibilità di nucleotidi trifosfato da ridurre, mentre un legame con dATP è indice di abbondanza di deossinucleotidi trifosfato, per cui non è richiesta attività enzimatica per crearne di nuovi.

Note


Life Free FullText The Origin and Evolution of Ribonucleotide

Life Free FullText The Origin and Evolution of Ribonucleotide

PDB101 Molecule of the Month Ribonucleotide Reductase

ribonucleotide reductase free radical mechanism biochemistry bioquímica

Ribonucleotide reductase activity is coupled to DNA synthesis via